Тел. | ||
Факс | ||
Электронный адрес | ||
Заведующий структурным подразделением | Ильхам Айюб оглы Шахмурадов Член-корреспондент НАНА |
|
Общее количество сотрудников | 3 | |
Основные направления деятельности структурного подразделения | Создание инструментов биоинформатики - базы данных и методов для установления механизмов регуляции экспрессии эукариотических и прокариотических генов. Изучение особенностей организации, экспрессии и эволюции эукариотических геномов. Изучение феномена переноса ДНК (гена) в ядро из пластид и митохондрий у разных высших растений | |
Основные научные результаты структурного подразделения | Инструменты биоинформатики были созданы в сотрудничестве с исследователями Королевского колледжа Холлоуэй Лондонского университета, Университета науки и технологии имени короля Саудовской Аравии Абдаллы ибн Абд аль-Азиза, Softberry – Биоинформационной Фирмы США и Пакистанского информационно-технического института - COMSATS: База данных PlantProm растительной РНК-полимеразы II (Pol II), компьютерные программы TSSP-TCM и TSSPlant по поиску растительных промоторов Pol II, компьютерные программы PromH и PromHP по поиску промоторов Pol II в ортологических генных парах эукариот, компьютерная программа bTSSfinder по поиску промоторов принадлежащих к различным сигма классам у бактерии Escherichia coli и в цианобактериях, компьютерная программа POLYAR по поиску сайтов полиаденинга исходных мРНК в геноме человека, компьютерных программ Nsite, NsiteH и NsiteM по поиску сайтов связывания фактора транскрипции последовательностей ДНК у животных и растений. ДНК-последовательности пластидного и митохондриального происхождения выявлены в ядерных геномах некоторых высших растений и выяснены их возможные функциональные и эволюционные роли. Генные локусы, индуцируемые транскрипцией, потенциальные химерные гены были обнаружены в ядерных геномах растений Arabidopsis thaliana и Oryza sativa. japonica. Потенциальные карты-промоторы различных бактерий и ядерных геномов некоторых высших растений были установлены с использованием компьютерной программы TSSPlant. Исходя из анализа этих карт, было высказано предположение, что транскрипция одной и той же ДНК-области из альтернативных промоторов у высших растений и бактерий является широко распространенным явлением. |