Fizika-Riyaziyyat və Texnika Elmləri Bölməsi
İdarəetmə Sistemləri İnstitutu
Riyaziyyat və Mexanika İnstitutu
Nəsrəddin Tusi adına Şamaxı Astrofizika Rəsədxanası
Radiasiya Problemləri İnstitutu
İnformasiya Texnologiyaları İnstitutu
Akademik Yusif Məmmədəliyev adına Neft-Kimya Prosesləri İnstitutu
Akademik Murtuza Nağıyev adına Kataliz və Qeyri-üzvi Kimya İnstitutu
Akademik Əli Quliyev adına Aşqarlar Kimyası İnstitutu
Polimer Materialları İnstitutu
Geologiya və Geofizika İnstitutu
Akademik Həsən Əliyev adına Coğrafiya İnstitutu
Respublika Seysmoloji Xidmət Mərkəzi
Biologiya və Tibb Elmləri Bölməsi
Molekulyar Biologiya və Biotexnologiyalar İnstitutu
Akademik Abdulla Qarayev adına Fiziologiya İnstitutu
Torpaqşünaslıq və Aqrokimya İnstitutu
Nizami Gəncəvi adına Ədəbiyyat İnstitutu
Nəsimi adına Dilçilik İnstitutu
Məhəmməd Füzuli adına Əlyazmalar İnstitutu
Memarlıq və İncəsənət İnstitutu
Nizami Gəncəvi adına Milli Azərbaycan Ədəbiyyatı Muzeyi
Arxeologiya, Etnoqrafiya və Antropologiya İnstitutu
Akademik Ziya Bünyadov adına Şərqşünaslıq İnstitutu
Abbasqulu Ağa Bakıxanov adına Tarix İnstitutu
Fəlsəfə və Sosiologiya İnstitutu
Milli Azərbaycan Tarixi Muzeyi
AMEA RH-nin idarələri
Beynəlxal elmi əməkdaşlıq şöbəsi
AMEA-nın nəzdindəki təşkilatlar
“Azərbaycan Milli Ensiklopediyası” Elmi Mərkəzi
Gənc Alim və Mütəxəssislər Şurası
AMEA "Yüksək Texnologiyalar Parkı" Məhdud Məsuliyyətli Cəmiyyəti
Azərbaycan Respublikasının Elmi Tədqiqatların Əlaqələndirilməsi Şurası
AMEA-nın Regional Bölmələri
AMEA-nın Regional Elmi Mərkəzləri