Национальная Академия Наук Азербайджана

Глобальные усилия по борьбе с пандемией COVID-19 в значительной степени зависят от точных, быстрых и частых тестов на коронавирус SARS-CoV-2 — «тест, тест, тест», как прямо выразила его Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) , Во всем мире преобладающий подход к диагностике острых инфекций основан на КПЦР в реальном времени, методе, который усиливает и обнаруживает молекулы вирусной нуклеиновой кислоты в образцах, полученных из мазков из носа и горла. Однако для работы с qPCR требуется сложное и дорогое оборудование и специализированный персонал, что является существенными недостатками, например, в удаленных условиях или в условиях ограниченных ресурсов.

Ученые из Венского биоцентра и сотрудники в настоящее время вывели на новый уровень устоявшийся анализ обнаружения нуклеиновых кислот. Так называемая «петля-опосредованная изотермическая амплификация (RT-LAMP)», впервые разработанная двадцать лет назад, является дешевой, простой и быстрой, что делает ее в принципе идеальной альтернативой для обычного обнаружения SARS-CoV-2. Тем не менее, ограниченная чувствительность и устойчивость до сих пор сдерживали анализы на основе RT-LAMP от попадания в центр внимания для диагностики SARS-CoV-2. Улучшения, внесенные венской командой, преодолевают эти проблемы и делают RT-LAMP потенциальным изменением игры для скрининга населения, особенно в экономически неблагополучных странах.

Начиная с 5-минутного этапа лизиса, который «разрывает» клетки и вирусные частицы, RT-LAMP использует простую реакцию, в которой вирусная РНК превращается в ДНК и амплифицируется в миллиарды раз менее чем за 30 минут. Генерирование такого огромного количества ДНК можно наблюдать невооруженным глазом путем визуального изменения цвета от фиолетового до небесно-голубого в реакционной пробирке. Сочетание этого метода с простым этапом обогащения РНК лежит в основе недавно разработанного метода, поскольку он повышает чувствительность на порядки величины. Не требуется ни специализированного лабораторного оборудования, ни экспертных навыков — самый сложный шаг — поддерживать образец при стабильной температуре примерно 63 ° С в течение 30 минут реакции — задача, которая может — при необходимости — быть выполнена путем повторного назначения кухонные приборы.

«Наш метод основан на существующих протоколах, разработанных для обнаружения патогенов», — говорит Юлиус Бреннеке из Института молекулярной биотехнологии (IMBA) Австрийской академии наук. «Для обнаружения SARS-CoV-2 нам удалось улучшить его до уровня, который соответствует чувствительности, подобной qPCR, к сырым образцам пациентов. Мы чрезвычайно взволнованы и с нетерпением ждем, когда они будут применены. Мы ожидаем, что эти улучшения, включая способность выполнять объединенный скрининг будет иметь реальное значение не только в развивающихся странах, но и в условиях ограниченных ресурсов в любой точке мира «. По его словам, сейчас очень нужны чувствительные, доступные и быстрые методы скрининга и диагностики SARS-CoV-2.

«То, как разворачивался весь этот проект, довольно необычно», — говорит Андреа Паули из Научно-исследовательского института молекулярной патологии (IMP). «Это началось как сумасшедшая идея, вызванная нашим убеждением, что как ученые мы должны действовать, чтобы помочь в нынешней пандемии. Благодаря замечательному совпадению Макс Келлнер, австрийский аспирант в институте LMB в Кембридже, который до этого опыт работы с методами изотермической амплификации, который оказался в его родном городе Вене во время блокировки. Когда мы узнали об этом, мы объединили его с аспирантами Венского биоцентра Джулианом Россом и Якобом Шнаблом. Итак, две группы, обычно работающие над оогенезом дрозофилы и эмбриология рыбок данио, объединившиеся и вступившие в новую область. Исключительный уровень командного духа и энтузиазма позволил нам продвинуть этот проект намного дальше, чем мы когда-либо предполагали, и сделал его уникальным опытом для всех участников. «

IMP и IMBA являются членами Венского биоцентра, и этот прорыв является свидетельством плодотворного духа сотрудничества, которым славится этот кампус. Период блокировки беспрецедентным образом усилил эту синергетическую активность в лабораториях и институтах. В то время как нормальная исследовательская деятельность к настоящему времени вернулась в лаборатории, ученые всего кампуса продолжают вкладывать свое время и знания в борьбу со вспышкой пандемии COVID-19. В рамках VCDI (Венская инициатива по диагностике COVID-19) они совместно работают над вопросами, которые открывают двери для приложений, которые могут принести пользу миллионам людей во всем мире.

news-medical.net